Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDB1Q16531 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDB1Q16531 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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