Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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VAMP3Q15836 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VAMP3Q15836 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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