Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
NPTX1Q15818 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
NPTX1Q15818 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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