Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ALX1Q15699 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ALX1Q15699 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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