Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PUM3Q15397 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PUM3Q15397 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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