Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTPRKQ15262 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRKQ15262 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
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