Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
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CHD4Q14839 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CHD4Q14839 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD4Q14839 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
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