Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TRIM25Q14258 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms