Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK13Q14004 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK13Q14004 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
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