Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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PDE6HQ13956 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PDE6HQ13956 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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