Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNTB1Q13884 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms