Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DDX39BQ13838 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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DDX39BQ13838 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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DDX39BQ13838 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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DDX39BQ13838 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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DDX39BQ13838 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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DDX39BQ13838 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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DDX39BQ13838 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DDX39BQ13838 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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