Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
APOFQ13790 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOFQ13790 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
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APOFQ13790 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOFQ13790 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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