Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ALCAMQ13740 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ALCAMQ13740 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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