Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CUL3Q13618 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
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CUL3Q13618 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CUL3Q13618 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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