Protein–RNA interactions for Protein: Q13569

TDG, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGQ13569 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDGQ13569 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDGQ13569 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDGQ13569 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDGQ13569 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDGQ13569 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TDGQ13569 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TDGQ13569 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDGQ13569 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDGQ13569 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDGQ13569 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDGQ13569 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TDGQ13569 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TDGQ13569 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TDGQ13569 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDGQ13569 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDGQ13569 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDGQ13569 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TDGQ13569 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms