Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NEUROD1Q13562 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms