Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC1Q13547 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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