Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATMQ13315 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ATMQ13315 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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