Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SKP2Q13309 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKP2Q13309 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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