Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF5Q13243 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SRSF5Q13243 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms