Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CBX3Q13185 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CBX3Q13185 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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