Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RPA4Q13156 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RPA4Q13156 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
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