Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRAF3Q13114 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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TRAF3Q13114 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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TRAF3Q13114 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TRAF3Q13114 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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