Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRDNQ13061 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRDNQ13061 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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