Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
PRDM2Q13029 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRDM2Q13029 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms