Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
FOXF1Q12946 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXF1Q12946 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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