Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLFN5Q08AF3 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms