Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSRP1Q08945 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms