Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PDE4CQ08493 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms