Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL9Q07325 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL9Q07325 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms