Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHRNDQ07001 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHRNDQ07001 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms