Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PTPN11Q06124 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN11Q06124 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms