Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CALD1Q05682 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CALD1Q05682 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms