Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SRSF11Q05519 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms