Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CAV1Q03135 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CAV1Q03135 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms