Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CYP4A11Q02928 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms