Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DSC2Q02487 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms