Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
EXOSC10Q01780 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms