Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CDK5Q00535 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CDK5Q00535 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms