Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM3AP98173 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms