Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFNB1P98172 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms