Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMF1P82094 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMF1P82094 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.64
TMF1P82094 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMF1P82094 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMF1P82094 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms