Protein–RNA interactions for Protein: P78426

NKX6-1, Homeobox protein Nkx-6.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX6-1P78426 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NKX6-1P78426 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms