Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ACTA1P68133 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ACTA1P68133 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms