Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
LMO4P61968 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
LMO4P61968 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO4P61968 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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LMO4P61968 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
LMO4P61968 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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