Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RIPPLY3P57055 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms