Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CACNB3P54284 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACNB3P54284 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms