Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CRISP1P54107 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRISP1P54107 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms