Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SUCLG1P53597 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms